MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 chromosome

Total Repeats: 45478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014758	TAG	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671970
2	NC_014758	TAC	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671970
3	NC_014758	AAT	2	6	149	154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671970
4	NC_014758	AT	4	8	177	184	50 %	50 %	0 %	0 %	313671970
5	NC_014758	AGTAAT	2	12	349	360	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313671970
6	NC_014758	ACG	2	6	438	443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313671970
7	NC_014758	AT	3	6	448	453	50 %	50 %	0 %	0 %	313671970
8	NC_014758	A	6	6	472	477	100 %	0 %	0 %	0 %	313671970
9	NC_014758	T	8	8	486	493	0 %	100 %	0 %	0 %	313671970
10	NC_014758	AAAAGA	2	12	556	567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313671970
11	NC_014758	CGG	2	6	595	600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313671970
12	NC_014758	A	6	6	634	639	100 %	0 %	0 %	0 %	313671970
13	NC_014758	TAG	2	6	646	651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671970
14	NC_014758	AATA	2	8	652	659	75 %	25 %	0 %	0 %	313671970
15	NC_014758	A	7	7	706	712	100 %	0 %	0 %	0 %	313671970
16	NC_014758	A	6	6	800	805	100 %	0 %	0 %	0 %	313671970
17	NC_014758	ATT	2	6	818	823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671970
18	NC_014758	TGG	2	6	885	890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671970
19	NC_014758	C	6	6	906	911	0 %	0 %	0 %	100 %	313671970
20	NC_014758	CAAA	2	8	927	934	75 %	0 %	0 %	25 %	313671970
21	NC_014758	TCGC	2	8	1079	1086	0 %	25 %	25 %	50 %	313671970
22	NC_014758	ATG	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671970
23	NC_014758	CAA	2	6	1173	1178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313671970
24	NC_014758	GAG	2	6	1220	1225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671970
25	NC_014758	TA	3	6	1264	1269	50 %	50 %	0 %	0 %	313671970
26	NC_014758	ATA	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671970
27	NC_014758	CAC	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313671971
28	NC_014758	GAG	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671971
29	NC_014758	GGA	2	6	1463	1468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671971
30	NC_014758	ACA	2	6	1471	1476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313671971
31	NC_014758	ATC	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671971
32	NC_014758	AAC	2	6	1528	1533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313671971
33	NC_014758	CAA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313671971
34	NC_014758	AAAC	2	8	1589	1596	75 %	0 %	0 %	25 %	313671971
35	NC_014758	TGG	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671971
36	NC_014758	TTC	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671971
37	NC_014758	GGT	2	6	1707	1712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671971
38	NC_014758	ATGC	2	8	1737	1744	25 %	25 %	25 %	25 %	313671971
39	NC_014758	TAA	2	6	1751	1756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671971
40	NC_014758	TA	4	8	1789	1796	50 %	50 %	0 %	0 %	313671971
41	NC_014758	AAATG	2	10	1814	1823	60 %	20 %	20 %	0 %	313671971
42	NC_014758	AT	3	6	1852	1857	50 %	50 %	0 %	0 %	313671971
43	NC_014758	TAT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671971
44	NC_014758	GAT	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671971
45	NC_014758	GAG	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671971
46	NC_014758	ACC	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313671971
47	NC_014758	AT	4	8	2134	2141	50 %	50 %	0 %	0 %	313671971
48	NC_014758	ATA	2	6	2188	2193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671971
49	NC_014758	A	6	6	2274	2279	100 %	0 %	0 %	0 %	313671971
50	NC_014758	TAA	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671971
51	NC_014758	A	7	7	2300	2306	100 %	0 %	0 %	0 %	313671971
52	NC_014758	TTA	2	6	2332	2337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671971
53	NC_014758	CAG	2	6	2367	2372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313671971
54	NC_014758	TATCC	2	10	2404	2413	20 %	40 %	0 %	40 %	313671971
55	NC_014758	TAC	2	6	2506	2511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671971
56	NC_014758	AAT	2	6	2877	2882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671972
57	NC_014758	ATACAA	2	12	2939	2950	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313671972
58	NC_014758	TTC	2	6	2951	2956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671972
59	NC_014758	CT	3	6	3013	3018	0 %	50 %	0 %	50 %	313671972
60	NC_014758	ATT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671972
61	NC_014758	TTC	2	6	3133	3138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671972
62	NC_014758	ATC	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671972
63	NC_014758	TTC	2	6	3255	3260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671972
64	NC_014758	TG	3	6	3295	3300	0 %	50 %	50 %	0 %	313671972
65	NC_014758	CGA	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313671972
66	NC_014758	ATC	2	6	3393	3398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671972
67	NC_014758	TTA	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671972
68	NC_014758	TGA	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671972
69	NC_014758	AT	3	6	3556	3561	50 %	50 %	0 %	0 %	313671972
70	NC_014758	ATT	2	6	3600	3605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671972
71	NC_014758	GTC	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313671972
72	NC_014758	ATA	2	6	3656	3661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671972
73	NC_014758	TTC	2	6	3671	3676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671972
74	NC_014758	TATCTT	2	12	3710	3721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313671972
75	NC_014758	CAGAT	2	10	3722	3731	40 %	20 %	20 %	20 %	313671972
76	NC_014758	TAAAT	2	10	3774	3783	60 %	40 %	0 %	0 %	313671972
77	NC_014758	TA	3	6	3909	3914	50 %	50 %	0 %	0 %	313671972
78	NC_014758	TCT	2	6	4036	4041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671973
79	NC_014758	TAA	2	6	4142	4147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671973
80	NC_014758	TAA	2	6	4159	4164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671973
81	NC_014758	T	7	7	4178	4184	0 %	100 %	0 %	0 %	313671973
82	NC_014758	TGA	2	6	4205	4210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671973
83	NC_014758	TAT	2	6	4236	4241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671973
84	NC_014758	A	8	8	4247	4254	100 %	0 %	0 %	0 %	313671973
85	NC_014758	T	6	6	4318	4323	0 %	100 %	0 %	0 %	313671973
86	NC_014758	T	6	6	4343	4348	0 %	100 %	0 %	0 %	313671973
87	NC_014758	AAG	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671973
88	NC_014758	T	6	6	4376	4381	0 %	100 %	0 %	0 %	313671973
89	NC_014758	AGAT	2	8	4382	4389	50 %	25 %	25 %	0 %	313671973
90	NC_014758	T	6	6	4393	4398	0 %	100 %	0 %	0 %	313671973
91	NC_014758	AT	3	6	4405	4410	50 %	50 %	0 %	0 %	313671973
92	NC_014758	TAA	2	6	4436	4441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671973
93	NC_014758	A	10	10	4454	4463	100 %	0 %	0 %	0 %	313671973
94	NC_014758	TAA	2	6	4561	4566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671973
95	NC_014758	GA	3	6	4598	4603	50 %	0 %	50 %	0 %	313671973
96	NC_014758	T	7	7	4626	4632	0 %	100 %	0 %	0 %	313671973
97	NC_014758	ATC	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671973
98	NC_014758	TGA	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671973
99	NC_014758	TCT	2	6	4667	4672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671973
100	NC_014758	A	7	7	4691	4697	100 %	0 %	0 %	0 %	313671973
101	NC_014758	TAT	2	6	4699	4704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671973
102	NC_014758	CTT	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671973
103	NC_014758	TGT	2	6	4797	4802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313671973
104	NC_014758	T	6	6	4811	4816	0 %	100 %	0 %	0 %	313671973
105	NC_014758	GTT	2	6	4821	4826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313671973
106	NC_014758	A	6	6	4838	4843	100 %	0 %	0 %	0 %	313671973
107	NC_014758	TTC	2	6	4852	4857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671973
108	NC_014758	T	7	7	4901	4907	0 %	100 %	0 %	0 %	313671973
109	NC_014758	T	6	6	4934	4939	0 %	100 %	0 %	0 %	313671973
110	NC_014758	ATATAA	2	12	4966	4977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671973
111	NC_014758	TAT	2	6	4994	4999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671974
112	NC_014758	AAT	2	6	5013	5018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671974
113	NC_014758	GAA	2	6	5037	5042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671974
114	NC_014758	CAT	2	6	5124	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671974
115	NC_014758	TGGA	2	8	5209	5216	25 %	25 %	50 %	0 %	313671974
116	NC_014758	GAT	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671974
117	NC_014758	ATCC	2	8	5259	5266	25 %	25 %	0 %	50 %	313671974
118	NC_014758	AGT	2	6	5291	5296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671974
119	NC_014758	CT	3	6	5567	5572	0 %	50 %	0 %	50 %	313671974
120	NC_014758	AG	3	6	5586	5591	50 %	0 %	50 %	0 %	313671974
121	NC_014758	TGG	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671974
122	NC_014758	CTT	2	6	5715	5720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671974
123	NC_014758	TGA	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671974
124	NC_014758	TGT	3	9	5759	5767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313671974
125	NC_014758	TGA	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671974
126	NC_014758	AAT	2	6	5823	5828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671974
127	NC_014758	ATAC	2	8	5829	5836	50 %	25 %	0 %	25 %	313671974
128	NC_014758	AGA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671974
129	NC_014758	GGT	2	6	5844	5849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671974
130	NC_014758	AC	3	6	5850	5855	50 %	0 %	0 %	50 %	313671974
131	NC_014758	TCT	2	6	5871	5876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671974
132	NC_014758	TAA	2	6	5891	5896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671974
133	NC_014758	TCA	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671974
134	NC_014758	GAC	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313671974
135	NC_014758	AGGGA	2	10	5955	5964	40 %	0 %	60 %	0 %	313671974
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137	NC_014758	T	7	7	6086	6092	0 %	100 %	0 %	0 %	313671974
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